วิธีคำนวณจุดไอโซอิเล็กทริกของเปปไทด์

ผู้เขียน: Robert White
วันที่สร้าง: 2 สิงหาคม 2021
วันที่อัปเดต: 13 พฤศจิกายน 2024
Anonim
How To Calculate The Isoelectric Point of Amino Acids and Zwitterions
วิดีโอ: How To Calculate The Isoelectric Point of Amino Acids and Zwitterions

เนื้อหา

เปปไทด์เป็นชิ้นส่วนของพอลิเมอร์สั้น ๆ ที่ประกอบด้วยกรดอะมิโน เปปไทด์แต่ละตัวมีลำดับของกรดอะมิโนที่ระบุด้วยรหัสตัวอักษรสามตัวหรือเพียงตัวเดียว ตัวอย่างเช่นกรดอะมิโนอะลานีนเรียกโดยย่อว่า "Ala" หรือ "A" ภาระของเปปไทด์ในสารละลายขึ้นอยู่กับความเป็นกรด จุดไอโซอิเล็กทริก (pI) หมายถึงค่าความเป็นกรดของสารละลายที่โมเลกุลเปปไทด์มีประจุสุทธิเท่ากับศูนย์ ความสามารถในการละลายของเปปไทด์มีน้อยที่จุดไอโซอิเล็กทริก ใช้เว็บเซิร์ฟเวอร์ที่มีอยู่เพื่อคำนวณค่า pI สำหรับลำดับกรดอะมิโนของเปปไทด์

ขั้นตอนที่ 1

จัดลำดับเปปไทด์โดยใช้รหัสตัวอักษรเดียว ตัวอย่างเช่นถ้าเปปไทด์มีลำดับกรดอะมิโน Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (อะลานีน - ซีรีน - กรดกลูตามิก - ลิวซีน - โพรลีน) ลำดับตัวอักษรหนึ่งตัวจะเป็น "ASELP" หากจำเป็นโปรดดูตารางการแปลงหนึ่งตัวอักษรถึงสามตัวอักษรที่ให้ไว้ในส่วนทรัพยากร


ขั้นตอนที่ 2

ใช้เบราว์เซอร์ใดก็ได้เช่น Internet Explorer หรือ Firefox เพื่อเข้าสู่เซิร์ฟเวอร์ที่คำนวณจุดไอโซอิเล็กทริกของเปปไทด์ (pI) ดูแหล่งข้อมูล

ขั้นตอนที่ 3

พิมพ์ลำดับตัวอักษรเดียวของเปปไทด์ - ในตัวอย่างของเรา "ASELP" - ลงในช่องแล้วคลิก "Compute"

ขั้นตอนที่ 4

อ่านค่าของจุดไอโซอิเล็กทริก (pI) ที่ระบุในบรรทัดของ "Theoretical pI / Mw" (theoretical pl) ในตัวอย่างของเรา pI คือ 4.00 โปรดทราบว่าเซิร์ฟเวอร์จะคำนวณน้ำหนักโมเลกุล (Mw) ของเปปไทด์ด้วย