วิธีคำนวณอัตราการกลายพันธุ์

ผู้เขียน: Rachel Coleman
วันที่สร้าง: 28 มกราคม 2021
วันที่อัปเดต: 7 พฤษภาคม 2024
Anonim
How to calculate effective population size
วิดีโอ: How to calculate effective population size

เนื้อหา

อัตราการกลายพันธุ์คือโอกาสที่นิวคลีโอไทด์ถูกละเว้นหรือเปลี่ยนแปลงในดีเอ็นเอที่เกิดจากความผิดพลาดตามธรรมชาติในการประมวลผลดีเอ็นเอ (การกลายพันธุ์ที่เกิดขึ้นเอง) หรือโดยตัวแทนภายนอก (การกลายพันธุ์ที่เกิดขึ้น) ไม่ควรสับสนอัตรานี้กับความถี่ของการกลายพันธุ์ซึ่งเป็นจำนวนเหตุการณ์การกลายพันธุ์ในรุ่นที่กำหนด โดยปกติแล้วอัตราการกลายพันธุ์ของสิ่งมีชีวิตชนิดใดชนิดหนึ่งมักจะคาดการณ์ได้จากข้อมูลโดยเปรียบเทียบลำดับดีเอ็นเอทั้งหมดในภาพตัดขวางของสิ่งมีชีวิตกับลูกหลานของพวกมัน ในห้องปฏิบัติการมักทำโดยการแยกตัวอย่างของสิ่งมีชีวิตและปล่อยให้พวกมันขยายพันธุ์ไปหลายชั่วอายุคน

การคำนวณอัตราการกลายพันธุ์ของสายพันธุ์

ขั้นตอนที่ 1

เพื่ออำนวยความสะดวกในกระบวนการนี้ให้หากลุ่มตัวอย่างของสายพันธุ์กระเทย (ซึ่งผสมพันธุ์ไข่ของพวกมันเองและไม่ต้องการคู่ครอง) ที่ผสมพันธุ์ได้อย่างรวดเร็วและคุณสามารถสืบพันธุ์สภาพความเป็นอยู่ในห้องปฏิบัติการ Caenorhabditis Elegans เป็นพยาธิตัวกลมขนาดเล็กที่มีคุณสมบัติตรงตามเกณฑ์เหล่านี้และได้รับการทดสอบอัตราการกลายพันธุ์มาก่อน


ขั้นตอนที่ 2

ลำดับและบันทึกดีเอ็นเอของสายพันธุ์ของคุณ

ขั้นตอนที่ 3

แยกบุคคลในสายพันธุ์ต่างๆให้ได้มากที่สุดเพื่อให้คุณจัดการดูแลรักษาและสังเกตเป็นระยะเวลานานภายใต้เงื่อนไขที่สิ่งมีชีวิตเป็นที่รู้กันว่าเจริญเติบโต ซึ่งจะช่วยลดผลกระทบของการคัดเลือกโดยธรรมชาติโดยการลดตัวอย่างทางพันธุกรรมของคุณ

ขั้นตอนที่ 4

สำหรับสิ่งมีชีวิตแต่ละรุ่นให้เก็บลูกหลานเพียงคนเดียว

ขั้นตอนที่ 5

ปล่อยให้หลายชั่วอายุคนมากที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้ที่จะเกิดขึ้นและตายโดยสังเกตว่ามีกี่รุ่นที่ผ่านไปสำหรับแต่ละเชื้อสาย

ขั้นตอนที่ 6

นำตัวอย่างดีเอ็นเอแบบสุ่มหรือแบบสมบูรณ์จากลูกหลานสุดท้ายของคุณและเปรียบเทียบกับลำดับของสายพันธุ์ดั้งเดิม นับจำนวนการเปลี่ยนแปลง

ขั้นตอนที่ 7

ในตอนท้ายของการทดลองของคุณให้ใช้สมการต่อไปนี้เพื่อคำนวณอัตราการกลายพันธุ์ของสายพันธุ์ของคุณ: µ = m / (L x g x b)

โดยที่: µ = อัตราการกลายพันธุ์ m = จำนวนการกลายพันธุ์ที่สังเกตได้ L = จำนวนสายพันธุ์ทดลอง g = จำนวนเฉลี่ยของรุ่น b = จำนวนคู่ฐานที่เรียงลำดับ